главная настройка

В dconf:

/org/mate/desktop/font-rendering/dpi

Почему-то они не желают ее читать с Х-сервера, а желают устанавливать фиксированно. Установка ее в реалистичный размер делает умолчальные шрифты человеческими вместо крохотных. Зато, правда, теперь надо везде убавлять настройки шрифтов.

P.S. настоящее разрешение находится так:
xdpyinfo | grep resolution

P.P.S. Для программ, честно следующих стандарту, еще надо написать в $HOME/.Xresources

Xft.dpi: правильное-разрешение